Manchmal ist aber auch der Verleih Schuld. Red Alert ist ja nur in Deutschland Command & Conquer 2 und Tiberian Sun deswegen auch nur hierzulande C&C3. Ich glaube Red Alert 2 wurde hierzulande dementsprechend auch erst als C&C4 angekündigt, was dann aber nochmal revidiert wurde. Kann aber auch sein, dass die Magazine einfach in vorauseilendem Gehorsam erst mit C&C4 warben.
Fate of Atlantis wurde auch offiziell von LucasArts als vierter Teil beworben, die Exe hieß ja auch Indy4.exe. Damit ist es ein alternativer 4. Teil. Da das Spiel so erfolgreich war (im deutschsprachigen Raum), wurde Turm von Babel auch eben als Indy 5 bezeichnet, aber nie offiziell. Da Turm von Babel aber auch damals noch bekannt war, wussten halt die meisten, was gemeint ist.
George Lucas hatte nach Young Indiana Jones seine Serie offiziell in Kapitel unterteilt. Indy 2 ist Kapitel 23, dann Indy 1 und 3,4,5

Indiana Jones und die Legende der Kaisergruft. Keine Ahnung, ob die Gamestar das aus Gründen des Layouts so verkürzt oder besser gesagt verballhornt hat, aber allgemein werden die Spiele ab Fate of Atlantis praktisch an die alten Filme drangehängt, also "Atlantis" ist Indy 4, Turm von Babel Indy 5 und die Kaisergruft eben Indy 6. Apropos Gruft: konnte damals ja keiner ahnen, dass Harris... INDIANA JONES nicht mittelfristig in dieselbe eingefahren ist, sondern bis heute und mit Anfang 80 auf der Leinwand rumprügelnd archäologisiert und somit die Aufzählung der Spiele eigentlich obsolet ist.