Den Klassiker Project 64 v1.6 mit den Plugins von Jabo. Es wird zwar an neueren Versionen gearbeitet, aber da bekommt man nur Betas gegen Bezahlung. Die 1.6 Version mit letzten Patch von Jabo von 2011 gibt es hier.
LINKAlternativ dazu gibt es ICE64, der früher mal als 1964 bekannt war und sehr gut funktionierte. Als ICE64 Neuauflage habe ich aber noch nicht ausprobiert. Soll aber sehr vielversprechend sein.
LINKEdit: In Project 64 kannst du neben dem Jabo Plugin auch noch das Glide 64 Final Plugin benutzen, was mit manchen Spielen besser läuft. Nicht vergessen die Glide3x.dll Datei auch mit in der Ordner der Project64.exe zu kopieren.
Glide 64 Final Plugin